La mer, comme les grottes terrestres, est un espace hors de portée des observations communes. Pour cette raison, elle est malheureusement systématiquement utilisée comme décharge (tout comme les grottes de façon plus sporadique), ce qui entraîne un déclin de la qualité des eaux de baignade et une dégradation des fonds marins.
Le projet GIONHA aborde ce thème en élaborant une cartographie géo-référencée des déchets dans l’aire transfrontalière à partir des données relatives à la Toscane. Ces données ont été collectées par l’ARPAT en appliquant le protocole national qui permet de mesurer aussi bien les peuplements halieutiques et que les déchets d’origine humaine. Parallèlement, la région Ligure et la province de Livourne mènent une action pilote de collecte des déchets et de nettoyage des fonds à plus de 50 m de profondeur, le long du littoral ligure comme sur les côtes toscanes, avec la participation active des pêcheurs, des associations écologiques, des communes et des touristes.

Cartographie géo-référencée des déchets
Les activités de suivi sur les ressources marines, réalisées pendant les campagnes de pêche scientifique au chalut, ont montré la grande quantité de déchets présents en mer. Les activités du projet GIONHA prévoient à ce sujet de réaliser une cartographie géo-référencée des déchets dans l’aire transfrontalière à partir des données relatives à la Toscane. Celles-ci ont été  collectées par l’ARPAT pendant le des campagnes de pêche scientifique à l’aide de chaluts (données GRUND et MEDLEM). Les prises halieutiques peuvent être corrélées avec la présence des déchets anthropiques : on estime qu’en une heure, sur l’ensemble du territoire de l’archipel toscan, on peut remonter environ 40 kg de déchets à bord du bateau de pêche.

Actions pilotes
Le projet GIONHA prévoit une action pilote de collecte des déchets présents sur les fonds d’une profondeur supérieure à 50 m. Cette action est promue et réalisée par la région Ligure, en collaboration avec l’Observatoire ligure de la pêche et de l’environnement (OLPA) et la province de Livourne. La collecte est réalisée par les pêcheurs qui participent à l’initiative en employant leurs chaluts pendant les périodes de pêche moins intense. La méthode élaborée prévoit l’élimination à terre des déchets récupérés, avec le concours des communes intéressées, des directions des ports d’attache des bateaux de pêche impliqués dans le projet et les entreprises de traitement des déchets.
Dans chaque aire de débarquement, on assurera la collecte et la révision des informations provenant des activités en mer grâce à la prise en compte et à l’élaboration des données inscrites sur des fiches techniques de relevé accompagnées de photos. Toutes les fiches remplies au cours de la période d’étude permettront d’élaborer les données définitives à la fin de la saison.

Campagne “MER et FONDS PROPRES”
Une campagne de sensibilisation itinérante sur le nettoyage des fonds marins a été réalisée en 2010 : « Mer et fonds et propre » (Mare e fondali puliti). Cette initiative de la région Ligure a été réalisée dans plusieurs communes et petits ports touristiques le long du littoral ligure. De jeunes spécialistes de la question, des pêcheurs professionnels, des plongeurs, des maîtres nageurs et des touristes se sont engagés dans les activités de nettoyage des plages, des pièces d’eau et des fonds d’une profondeur inférieure à 50 m.